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CPU time, wall clock time (포트란)

병렬 컴퓨팅이 일반화 되지 않은 상황에서는 주로 CPU time을 비교하곤 했다. 하지만, 포트란77의 경우 CPU 시간을 측정하는 방법이 언어에서 지원되질 않았다. 유닉스 명령어 time을 활용하면 그럭저럭 데이터를 얻을 수 있으나, 반드시 시스템을 혼자 사용하고 있다는 확신이 서야한다. 아니 감시를 해야만 한다. ...

숫자로 된 파일 이름들 (포트란) number2string

포트란에서 출력 파일들을 여러개로 만들 수 있다. 기본 출력이외에 따로 모셔 둘 데이터가 있을 수 있다는 말씀이다. 이러한 경우, 각각에 대해서 미리 이름을 만들어 줄 수 있다. 즉, open(1, file='abc', form='formatted')여기서 이야기 하려고 하는것은 숫자로 파일 이름을 대체하고 싶을 때이다.다시 말해서, 1이 스트링이 되어...

포트란 90, 기본

포트란90에서 가능한 문법들과 매우 편리한 계산방법들을 몇 가지 나열했다.  이것은 기본 키워드들의 나열과 비슷한 양태를 나타내고 있다.  계산을 위한 많은 직관적인 장치들이 많이 도입되었다. 포트란90 에서는 특별히, 벡터, 행렬들의 취급이 매우 용이해졌다고 볼 수 있다. 포트란77 형식의 프로그래밍 기법과 비교하여 do 문...

MPI (Message Passing Interface)

MPI (Message Passing Interface) 란 무엇인가?MPI 자체는 병렬 라이브러리들에 대한 표준규약이다. (125개의 서브 프로그램들로 구성되어 있다.) MPI로 만들어진 병렬 라이브러리를 사용한다면 작성된 응용프로그램이 source level의 호환성을 보장받을 수 있다. MPI는 약 40개 기관이 참여하는 MPI forum에서 관리...

infiniband latency

http://vmi.ncsa.uiuc.edu/performance/pmb_lt.phpFast EthernetGigabit EthernetMyrinetQuadrics 2latency120 microsecond120 microsecond7 microsecond0.5 microsecondbandwidth100 Mbps1 Gbps1.98 Gbps1 Gbyte/...

pbsnodes 명령어/클러스터

man pbsnodesNAMEpbsnodes - pbs node manipulationSYNOPSISpbsnodes [-{c|o|r}] [-s server] [nodename ...]pbsnodes -{a|l} [-s server]DESCRIPTIONThe pbsnodes command is used to mark nodes down, free or o...

병렬계산을 위한 컴퓨터 구조들

병렬처리:컴퓨터에서 병렬처리란 프로그램 명령어를 여러 프로세서에 분산시켜 동시에 수행함으로써 빠른 시간 내에 원하는 답을 구하는 작업을 일컫는다. 초기의 컴퓨터에서는 한번에 오직 하나의 프로그램만 수행되었다. 예를 들어, 계산 수행에 1시간 걸리는 프로그램과, 테이프에서 데이터 읽기에 1시간 걸리는 프로그램이 있다면, 이 두 프로그램을 수행시키는데는 총...

과학기술자를 위한 포트란 90 (FORTRAN 90), MPI (병렬처리), 파이썬 (Python)

물리학자를 위한 포트란 90 (FORTRAN 90), MPI (병렬처리), 파이썬 (Python) ---> 과학기술자를 위한 포트란 90 (FORTRAN 90), MPI (병렬처리), 파이썬 (Python)제 경험을 바탕으로 정리한 포트란 90, MPI, 파이썬에 대한 노트들이라고 생각하시면 좋을 것 같습니다. 제 경험들을 간략하게 항목별로 적어 ...

물리학 제3의 방편: 전산 물리학

물리학 제3의 방편: 전산 물리학 2003년 9월 27일전산 물리학 (computational physics)은 컴퓨터 관련 자원들을 이용하여 물리학 고유의 문제를 풀고 해석하는 연구분야를 말한다. 전산 물리학은 물리학적 실험 데이터를 설명할 수 있을 뿐만 아니라 실험 결과를 예측할 수 있는 구체적인 계산체계 수립과 이에 따른 직접적인 수치 계산들을 포...

ADMD (작용유도 분자동역학) 홈페이지 오픈

ADMD홈페이지 오픈: Where transition-pathway search is part of the pleasure. 관련 자료: action-derived molecular dynamics_ from algorithms to applications.pdfaction-derived molecular dynamics (ADMD) : 작용유도 분자동...
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