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polynomial curve fitting {Fortran 90 / Python} [algorithm]

Least Squares Fitting--Polynomial (최소 자승 다항식 맞추기) http://mathworld.wolfram.com/LeastSquaresFittingPolynomial.htmlPolynomial regression (다항식 회귀)http://en.wikipedia.org/wiki/Polynomial_regressionCurve...

SilverFrost FTN95 ; free fortran 95 compiler (Windows)

Windows용 포트란 95 컴파일러(무료)를 소개합니다.http://en.wikipedia.org/wiki/Silverfrost_FTN95Silverfrost FTN95: Fortran for Windows is a Fortran compiler for Microsoft Windows. It generates code for native IA-32 W...

string method (LJ potential) [algorithm]

string method (LJ potential) [algorithm]cf. Nudged Elastic Band (NEB) methodtransition pathway/ minimum energy path/ transition state를 찾는 방법 중 하나로 알려진 string method의 간단한 사용예를 보였다.참고:http://web....

Local minimization, Lennard-Jones potential [algorithm]

1차 미분과 함수 값을 이용한 구조 최적화 문제의 실제 예를 보여준다.LJ  potential:http://incredible.egloos.com/4242358LJ cluster 구조 변형 기작 시뮬레이션: http://incredible.egloos.com/4660981      implicit n...

Crooks' fluctuation theorem

incredible Jarzynski's identityCrooks' fluctuation theoremhttp://en.wikipedia.org/wiki/Crooks_fluctuation_theoremthe joint probability of taking a microstate {\displaystyle A} fr...

복제품-맞바꿈 분자동역학 (replica-exchange molecular dynamics; REMD) [algorithm]

분자동역학 (molecular dynamics) 입문복제품-맞바꿈 분자동역학(replica-exchange molecular dynamics; REMD) parallel tempering이라고도 불리우는 계산 방법이다.  주로 주어진 온도에서 관심있는 시스템의 열역학적 물리량을 계산할 때 사용된다.(1) 몇 개의 서로 다른 온...

2nd KIAS CAC Summer School on Parallel Computing

2nd KIAS CAC Summer School on Parallel ComputingJune 30 - July 2, 2011http://cac.kias.re.kr/School/2011summer/Important noticesDeadline for Application is June. 20, 2011. The list of participants wi...

포트란 파일 직접 접근(direct access) + MPI 파일 입출력

포트란 direct access 기법이  MPI 환경하에서 유용한 입출력 방식으로 사용되는 한 예를 소개합니다.포트란 문법에서 파일을 다룰 때, 디폴트는 순차적 (" sequential ") 접근을 의미한다.읽을 때, 적을 때 마찬가지이다.아래와 같은 경우, 통상 디폴트 옵션에 따라서  access=...

원주율 계산 (pi calculations) [병렬 계산]

병렬 계산에서는 CPU 사용 갯수에 의존하지 않고 항상 같은 결과를 만들어야한다.특히, random number를 사용하는 경우,  많은 사람들이 이를 무시하는 결과를 내어 놓는다. 하지만, 그것은 제대로 된 병렬 구현이 아니다.랜덤 넘버 제너레이션 씨드가 주어지면 노드 수에 상관없이 단 하나의 결과를 주어야 한다. 다시말해서...

Simpson's rule in C++, FORTRAN, and Python [algorithm]

https://en.wikipedia.org/wiki/Simpson%27s_rulehttp://incredible.egloos.com/3021478#include <iostream>#include <cmath>using namespace std;double func(double x){    &nb...
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